MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 96261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011369	CGG	2	6	639	644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547613
2	NC_011369	GC	4	8	753	760	0 %	0 %	50 %	50 %	209547613
3	NC_011369	CAC	2	6	856	861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547613
4	NC_011369	CAA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209547613
5	NC_011369	TCA	2	6	900	905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547613
6	NC_011369	C	6	6	1023	1028	0 %	0 %	0 %	100 %	209547613
7	NC_011369	GC	3	6	1031	1036	0 %	0 %	50 %	50 %	209547613
8	NC_011369	GCCG	2	8	1054	1061	0 %	0 %	50 %	50 %	209547613
9	NC_011369	CAG	2	6	1073	1078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547613
10	NC_011369	TTC	2	6	1084	1089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547613
11	NC_011369	TGC	2	6	1093	1098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
12	NC_011369	CGC	2	6	1122	1127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
13	NC_011369	CGC	2	6	1137	1142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
14	NC_011369	TCG	2	6	1170	1175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
15	NC_011369	GCC	2	6	1205	1210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
16	NC_011369	CTG	2	6	1295	1300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
17	NC_011369	GCG	2	6	1316	1321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547613
18	NC_011369	CGT	2	6	1345	1350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
19	NC_011369	ATG	2	6	1404	1409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547613
20	NC_011369	CGCTGA	2	12	1410	1421	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209547613
21	NC_011369	ATC	2	6	1451	1456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547613
22	NC_011369	GAC	2	6	1457	1462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547613
23	NC_011369	GAT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547613
24	NC_011369	TGC	2	6	1518	1523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
25	NC_011369	GTC	3	9	1541	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
26	NC_011369	GCC	2	6	1550	1555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
27	NC_011369	TCC	2	6	1665	1670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547613
28	NC_011369	TGC	2	6	1681	1686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
29	NC_011369	CCG	2	6	1801	1806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
30	NC_011369	TCGA	2	8	1826	1833	25 %	25 %	25 %	25 %	209547613
31	NC_011369	CGA	2	6	1840	1845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547613
32	NC_011369	TCG	2	6	1860	1865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
33	NC_011369	CGC	2	6	1880	1885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
34	NC_011369	TCG	2	6	1911	1916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
35	NC_011369	CCG	2	6	1957	1962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
36	NC_011369	CGC	2	6	2019	2024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
37	NC_011369	GCC	2	6	2043	2048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547613
38	NC_011369	CGG	2	6	2053	2058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547613
39	NC_011369	TGC	2	6	2076	2081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547613
40	NC_011369	GGC	2	6	2386	2391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547614
41	NC_011369	GGT	2	6	2497	2502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547614
42	NC_011369	CTG	2	6	2510	2515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547614
43	NC_011369	GC	4	8	2570	2577	0 %	0 %	50 %	50 %	209547614
44	NC_011369	CATT	2	8	2593	2600	25 %	50 %	0 %	25 %	209547614
45	NC_011369	CAC	2	6	2626	2631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547614
46	NC_011369	TCG	2	6	2640	2645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547614
47	NC_011369	CCGC	2	8	2658	2665	0 %	0 %	25 %	75 %	209547614
48	NC_011369	TCG	2	6	2703	2708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547614
49	NC_011369	GCA	2	6	2782	2787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547614
50	NC_011369	CTG	2	6	2798	2803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547614
51	NC_011369	GTC	2	6	2834	2839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547614
52	NC_011369	GGGTG	2	10	2872	2881	0 %	20 %	80 %	0 %	209547614
53	NC_011369	CGG	2	6	2926	2931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547614
54	NC_011369	CAC	2	6	2950	2955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547614
55	NC_011369	GGC	2	6	2960	2965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547614
56	NC_011369	TGA	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547614
57	NC_011369	CTT	3	9	3055	3063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547614
58	NC_011369	GCC	2	6	3124	3129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547614
59	NC_011369	GTC	2	6	3143	3148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547614
60	NC_011369	CGC	2	6	3160	3165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547614
61	NC_011369	GC	3	6	3208	3213	0 %	0 %	50 %	50 %	209547614
62	NC_011369	CGC	2	6	3242	3247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547614
63	NC_011369	GAC	2	6	3262	3267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547614
64	NC_011369	CGT	2	6	3277	3282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547614
65	NC_011369	CTG	2	6	3311	3316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547614
66	NC_011369	CCA	2	6	3402	3407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547614
67	NC_011369	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547615
68	NC_011369	CGA	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547615
69	NC_011369	GCT	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547615
70	NC_011369	CAG	2	6	3673	3678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547615
71	NC_011369	TCG	2	6	3683	3688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547615
72	NC_011369	AGCCG	2	10	3702	3711	20 %	0 %	40 %	40 %	209547615
73	NC_011369	CTC	2	6	3712	3717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547615
74	NC_011369	TCT	2	6	3792	3797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547615
75	NC_011369	CG	3	6	3804	3809	0 %	0 %	50 %	50 %	209547615
76	NC_011369	GCCG	2	8	3813	3820	0 %	0 %	50 %	50 %	209547615
77	NC_011369	GC	3	6	3822	3827	0 %	0 %	50 %	50 %	209547615
78	NC_011369	CCGG	2	8	3891	3898	0 %	0 %	50 %	50 %	209547615
79	NC_011369	CG	4	8	3933	3940	0 %	0 %	50 %	50 %	209547615
80	NC_011369	GAT	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547615
81	NC_011369	GCTT	2	8	4088	4095	0 %	50 %	25 %	25 %	209547615
82	NC_011369	CCGG	2	8	4128	4135	0 %	0 %	50 %	50 %	209547615
83	NC_011369	CG	3	6	4173	4178	0 %	0 %	50 %	50 %	209547615
84	NC_011369	CAT	2	6	4209	4214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547615
85	NC_011369	GCCG	2	8	4218	4225	0 %	0 %	50 %	50 %	209547615
86	NC_011369	ATC	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547615
87	NC_011369	CGAG	2	8	4263	4270	25 %	0 %	50 %	25 %	209547615
88	NC_011369	GCCG	2	8	4282	4289	0 %	0 %	50 %	50 %	209547615
89	NC_011369	GGCA	2	8	4357	4364	25 %	0 %	50 %	25 %	209547615
90	NC_011369	TCA	2	6	4416	4421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547615
91	NC_011369	GCC	3	9	4432	4440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547615
92	NC_011369	CCG	2	6	4485	4490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547615
93	NC_011369	CGC	2	6	4579	4584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547615
94	NC_011369	GCA	2	6	4635	4640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547615
95	NC_011369	CG	3	6	4650	4655	0 %	0 %	50 %	50 %	209547615
96	NC_011369	GGC	2	6	4659	4664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547615
97	NC_011369	CAGG	2	8	4705	4712	25 %	0 %	50 %	25 %	209547616
98	NC_011369	CGC	2	6	4791	4796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547616
99	NC_011369	GCC	2	6	4861	4866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547616
100	NC_011369	GCG	2	6	4869	4874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547616
101	NC_011369	GAC	2	6	4879	4884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547616
102	NC_011369	CGC	2	6	4899	4904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547616
103	NC_011369	GTCC	2	8	4920	4927	0 %	25 %	25 %	50 %	209547616
104	NC_011369	GTGCG	2	10	4959	4968	0 %	20 %	60 %	20 %	209547616
105	NC_011369	CGT	2	6	4978	4983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547616
106	NC_011369	TCGCCA	2	12	5016	5027	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209547616
107	NC_011369	CG	3	6	5037	5042	0 %	0 %	50 %	50 %	209547616
108	NC_011369	ACC	2	6	5105	5110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547616
109	NC_011369	CGA	2	6	5214	5219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547616
110	NC_011369	CGG	2	6	5229	5234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547616
111	NC_011369	TGGC	2	8	5300	5307	0 %	25 %	50 %	25 %	209547616
112	NC_011369	ACG	2	6	5309	5314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547616
113	NC_011369	GCC	2	6	5425	5430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547617
114	NC_011369	CGCC	2	8	5463	5470	0 %	0 %	25 %	75 %	209547617
115	NC_011369	CATCG	2	10	5488	5497	20 %	20 %	20 %	40 %	209547617
116	NC_011369	GCG	2	6	5550	5555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547617
117	NC_011369	CGG	2	6	5578	5583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547617
118	NC_011369	CAG	2	6	5611	5616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547617
119	NC_011369	GAA	2	6	5635	5640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547617
120	NC_011369	GGC	2	6	5653	5658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547617
121	NC_011369	CGA	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547618
122	NC_011369	CGCCGG	2	12	5894	5905	0 %	0 %	50 %	50 %	209547618
123	NC_011369	GGCT	2	8	5968	5975	0 %	25 %	50 %	25 %	209547618
124	NC_011369	CGC	2	6	5984	5989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547618
125	NC_011369	GGC	2	6	5997	6002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547618
126	NC_011369	TCCA	2	8	6049	6056	25 %	25 %	0 %	50 %	209547618
127	NC_011369	GCC	2	6	6111	6116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547618
128	NC_011369	CGA	2	6	6176	6181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547618
129	NC_011369	GC	3	6	6184	6189	0 %	0 %	50 %	50 %	209547618
130	NC_011369	GCC	2	6	6228	6233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547618
131	NC_011369	GCCG	2	8	6240	6247	0 %	0 %	50 %	50 %	209547618
132	NC_011369	GCA	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547618
133	NC_011369	CGG	2	6	6336	6341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547618
134	NC_011369	TTC	2	6	6348	6353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547618
135	NC_011369	CAGG	2	8	6396	6403	25 %	0 %	50 %	25 %	209547618
136	NC_011369	TGC	2	6	6645	6650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547619
137	NC_011369	CGC	2	6	6679	6684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547619
138	NC_011369	TCG	2	6	6686	6691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547619
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140	NC_011369	CTG	2	6	6742	6747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547619
141	NC_011369	TGTCGC	2	12	6752	6763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547619
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143	NC_011369	GCCG	2	8	6832	6839	0 %	0 %	50 %	50 %	209547619
144	NC_011369	TCG	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547619
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146	NC_011369	GAT	2	6	6969	6974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547619
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148	NC_011369	TCA	2	6	7025	7030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547619
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150	NC_011369	TCG	2	6	7103	7108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547619
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155	NC_011369	GGC	2	6	7179	7184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547619
156	NC_011369	CGTC	2	8	7260	7267	0 %	25 %	25 %	50 %	209547619
157	NC_011369	TCG	2	6	7295	7300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547619
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166	NC_011369	TGG	2	6	7646	7651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547619
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173	NC_011369	GC	3	6	8179	8184	0 %	0 %	50 %	50 %	209547620
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239	NC_011369	CGA	2	6	12044	12049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547625
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243	NC_011369	AGC	2	6	12217	12222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547625
244	NC_011369	AAT	2	6	12239	12244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209547625
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247	NC_011369	CTG	2	6	12327	12332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547625
248	NC_011369	GCA	2	6	12337	12342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547625
249	NC_011369	CTT	2	6	12402	12407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547625
250	NC_011369	GCG	2	6	12450	12455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547625
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252	NC_011369	TGA	2	6	12482	12487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547625
253	NC_011369	GTCCTT	2	12	12498	12509	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	209547625
254	NC_011369	TCA	2	6	12512	12517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547625
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256	NC_011369	GAC	2	6	12549	12554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547625
257	NC_011369	TGG	2	6	12560	12565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547625
258	NC_011369	CGA	2	6	12641	12646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547625
259	NC_011369	TCG	2	6	12649	12654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547625
260	NC_011369	CG	3	6	12720	12725	0 %	0 %	50 %	50 %	209547625
261	NC_011369	AGTCGG	2	12	12909	12920	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209547626
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